En un hecho insólito que ya está siendo investigado por las autoridades chilenas y la organización del Dakar, el competidor francés de 25 años perdió la vida al chocar con un vehículo de los Carabineros chilenos que venía en sentido contrario mientras circulaba por el enlace tratando de llegar al punto de partida de la séptima etapa.
El piloto galo iba en el puesto 68 de la clasificación general del Dakar (Motos), evento en el que participaba por primera ocasión. Dentro de su palmarés, Bourgin tenía un cuarto puesto en el African Race de 2011 y fue séptimo en el Rally de Túnez de ese mismo año. En el comunicado de prensa, los organizadores del Dakar 2013 manifestaron escuetamente que: "Los equipos médicos del rally sólo pudieron comprobar el deceso del piloto, probablemente muerto de manera instantánea".
Thomas Bourgin se unió a la lista de 23 pilotos muertos en 34 años desde la realización de esta prueba de supervivencia en 1979.